Sistem je vzpostavljen na letališčih Brnik, Maribor Slivnica in Portorož ter v pristaniščih Koper in Piran. Z njegovo uvedbo se ukinja žigosanje potnih listov za kratkoročne obiske, nadomešča ga elektronski vnos osebnih in biometričnih podatkov.
EES beleži vstope in izstope potnikov, zavrnitve vstopa ter podatke iz potnih listin, prstne odtise in fotografije. Sistem zajema vse članice Evropske unije, z izjemo Cipra in Irske, ter Islandijo, Lihtenštajn, Norveško in Švico.
V prehodnem obdobju, ki je trajalo več mesecev, so države podatke vnašale postopno, ob tem pa še vedno uporabljale žige v potnih listih. Po novem bo nadzor potekal izključno digitalno.
Uvedba sistema je v zadnjih mesecih naletela tudi na kritike. Letalske organizacije in združenja prevoznikov opozarjajo na možnost zastojev, zlasti v času poletne sezone. Na zahtevnost postopkov so opozorili tudi prevozniki iz držav jugovzhodne Evrope.
Evropska komisija medtem navaja prve rezultate sistema. Od začetka uporabe je bilo zabeleženih več kot 45 milijonov prehodov meja, več kot 24.000 ljudem pa je bil vstop zavrnjen. Sistem je pomagal odkriti tudi več sto oseb, ki so predstavljale varnostno tveganje.
Zaradi biometričnih podatkov naj bi bil nadzor učinkovitejši, saj omogoča lažje odkrivanje zlorab identitete. Pri enem od primerov so pristojni organi ugotovili, da je posameznik uporabljal več različnih identitet, kar je omogočilo nadaljnjo preiskavo in preprečilo nov vstop v schengensko območje.
